鱼菜共生是一种新型的复合耕作体系，它把水产养殖与水耕栽培这两种原本完全不同的农耕技术，通过巧妙的生态设计，达到科学的协同共生，从而实现养鱼不换水而无水质忧患，种菜不施肥而正常成长的生态共生效应。在传统的水产养殖中，随着鱼的排泄物积累，水体的氨氮增加，毒性逐步增大。而在鱼菜共生系统中，水产养殖的水被输送到水培栽培系统，由细菌将水中的氨氮分解成亚硝酸盐然后被硝化细菌分解成硝酸盐，硝酸盐可以直接被植物作为营养吸收利用。鱼菜共生让动物、植物、微生物三者之间达到一种和谐的生态平衡关系，是可持续循环型零排放的低碳生产模式，更是有效解决农业生态危机的最有效方法。

从1997年开始，维尔京群岛大学的詹姆斯Rakocy博士和他的同事们研发出了一种基于深水栽培的大型鱼菜共生系统。之后，世界各国多个大学逐步开展相关技术研究，探索大规模鱼菜共生农业生产的技术方法。联合国粮农组织也把小型鱼菜共生系统作为可持续农业模式向全球推荐。近几年，规模化的鱼菜共生系统逐步在世界各地建设投产，室内的鱼菜共生工厂也开始出现。当前，整个鱼菜共生家庭园艺和农业产业正在快速发展。

在现有的鱼菜共生系统中，水泵将鱼池中的鱼粪和残饵抽到种植床，种植床上的陶粒寄生硝化细菌，它将鱼粪和残饵分解为可供植物吸收的养分。鱼池水经过陶粒的拦截过滤，并且其中的养分被植物吸收后，干净的池水通过虹吸装置，流回到鱼池。